همیشه دعوای طب سنتی با طب نوین یکی از موضوعات پر سر و صدا در کشور بوده است، پزشکی نوین توصیه‌های طب سنتی را قبول ندارد و می‌گوید غیر علمی و مستند بر شواهد علمی نیست، اما در آن سوی میدان، طب سنتی این ادعا را دارد که بیش از هزار سال سابقه درمان بیماری‌های مختلف در کشور را داشته و عارضه‌هایی که طب نوین نمی‌تواند آن را درمان کند طب سنتی و ایرانی به راحتی آن را درمان خواهد کرد.
به تازگی طرحی در کمیسیون اجتماعی مجلس مطرح شده و به موجب آن قرار است سازمان طب ایرانی در کشور راه اندازی شود، همین موضوع باعث شد تا طرفین دو قطبی طب سنتی و نوین موضع خود درقبال اجرای این طرح را بازگو کنند.
محمد رضا ظفر قندی رئیس کل سازمان نظام پزشکی در نامه‌ای به مجلس شورای اسلامی گفت که «امید است با اهتمام شما، از شأن و منزلت علم مبتنی بر شواهد و تخصص لازم در مقوله تأمین سلامت مردم، محافظت و از آسیبی که شبه علم و روش‌های غیرعلمی به مردم وارد می‌کنند، پیشگیری شود.»
او در این نامه ذکر کرده است «محتوای این طرح تشکیل سازمانی حرفه‌ای است و به افرادی که فاقد دانش کافی در مورد طبابت و سلامت انسان‌ها هستند، اجازه مداخله نظام‌مند در موضوع بسیار پیچیده و تخصصی سلامت و بیماری را می‌دهد؛ به نوعی به مداخلاتی که اینگونه افراد انجام می‌دهند، اعتبار و رسمیت می‌بخشد.
این در حالی است که منطقاً هر گونه مداخله مربوط به سلامت فارغ از ماهیت و تاریخچه آن، تنها در صورتی می‌تواند به صورت رسمی تجویز شود که بر اساس روش‌های علمی و عقلی، هم ایمنی و هم اثر بخشی آن روش تأیید شده باشد و توسط افرادی که به صورت نظام‌مند برای حرفه پزشکی و حرفه‌های وابسته آموزش کافی دیده اند؛ تجویز شوند. مداخلات طب مکمل هم قطعاً از این قاعده عمومی مستثنی نیستند.»
امیر صدری سرپرست روابط عمومی سازمان نظام پزشکی کشور سازمان نظام پزشکی با اشاره به مطرح شدن تشکیل سازمان طب مکمل در کمیسیون بهداشت مجلس کشور اظهار کرد: یک پزشک برای تشخیص بیماری مراجعه کننده خود نیازمند بررسی برخی از علائم و کنار هم قراردادن شواهد علمی است تا براساس دانش و منطق اقدام به تشخیص عارضه فرد بیمار کرده و داروی مناسب را تجویز کند. امروزه طب باید متکی بر شواهد علمی باشد و در مجامع علمی مختلف بین المللی مورد تایید قرار گرفته باشد.
او ادامه داد: منابع مختلف علمی بررسی و در صورت داشتن شواهد درست در مراکز مختلف مورد استفاده قرار می‌گیرد. پیروان طب سنتی، ایرانی مدام دلایلی متکی بر گذشته و تاریخ می‌آورند که این ادعا در شرایط کنونی قبول نیست.
صدری بیان کرد: در حال حاضر ایران در حوزه‌های پیوند کبد، کلیه و درمان‌های چشمی، ام اس و بسیاری از حوزه‌های دیگر در حال تولید علم بوده و جزو منابع مورد استناد مراکز علمی جهانی است؛ اما در نقطه مقابل متاسفانه هزاران نفر در حوزه‌های موسوم به سنتی و ایرانی مشغول به کار هستند، ولی فعالیت شان صرفا در حوزه‌های درآمدی و برخورد با بیماران است و به تولید علم نمی‌پردازند؛ در مراکز طب سنتی و ایرانی تاسیس شده شاهد انجام کار‌های علمی مبتنی بر شواهد قابل ارائه در سطح اول علمی دنیا تولید نمی‌شود.
او افزود: برخی از افراد فعال در حوزه طب سنتی برای درمان بیماری‌های مختلف مانند سرطان ادعا دارند، اما یکبار در مراکز علمی درجه یک حاضر به ارائه مدارک و شواهد و طرح ایده خود نشده اند. ما پذیرای علم مبتنی بر شواهد علمی هستیم و از فعالان این حوزه درخواست داریم که علم خود را به روز کنند.
