این مهاجم جوان با امید و آرزوی فراوان به پرسپولیس پیوست که پس از درخشش در این تیم بتواند به پیراهن تیم ملی بزرگسالان برسد اما فصل گذشته فرصت چندانی برای درخشش پیدا نکرد.
او تمرینات پیش فصل را با انگیزه‌ای بیشتر آغاز کرد و در دو بازی دوستانه اول تیمش خوش درخشید و همه را به خود امیدوار کرد. مهدی خانی اما در تاجیکستان و پیش از دیدار پرسپولیس با استقلال این کشور با بدشانسی بزرگی مواجه شد و در تمرین قبل از بازی دستش شکست و مجبور به جراحی شد.
این بازیکن پس از آن نتوانست در ترکیب پرسپولیس قرار بگیرد حالا دوران نقاهت را نیز پشت سرگذاشته است.
مهدی مهدی خانی ظاهرا مورد نظر عبدالله ویسی سرمربی اخراجی فولاد خوزستان بود. این مربی جنوبی پس از تساوی برابر تیم نفت مسجد سلیمان از این تیم برکنار شد و جای خودش را به جواد نکونام داد.
گویا سرمربی جدید فولاد خوزستان نظری روی مهدی مهدی خانی نداشته و به همین خاطر این مهاجم جوان که توانایی بازی در دو پُست وینگر و فروارد هدف را دارد در پرسپولیس ماندنی شد.
