در ۲۷ مارس ۱۹۸۹، مأموریت فوبوس-۲ اتحاد جماهیر شوروی به قمرهای مریخ با شکست پایان یافت، اما کل مأموریت قطعاً شکست نبود.
فوبوس-۲ آخرین کاوشگر فضایی طراحی‌شده توسط اتحاد جماهیر شوروی بود. این فضاپیما برای کشف اطلاعاتی از قمرهای مریخ، فوبوس و دیموس طراحی شده بود.
فوبوس-۲ در ۱۲ ژوئیه ۱۹۸۸ پرتاب شد و در ۲۹ ژانویه ۱۹۸۹ وارد مدار شد.
اندکی قبل از مرحله نهایی مأموریت که طی آن فضاپیما باید به پنجاه متری سطح فوبوس نزدیک می‌شد و دو فرودگر را در قمر رها می‌کرد، کنترل مأموریت با آن قطع شد و هدایت آن از دست رفت. علت این خرابی خطای کامپیوتری تشخیص داده شد.
فوبوس-۲ دو ماه زودتر به مدار مریخ رسید و درحال مطالعه مریخ و فوبوس، بزرگترین قمر این سیاره بود. در این مدت، ۳۷ عکس از فوبوس به زمین مخابره شد.
طیف‌سنج فروسرخ فوبوس 2 در مادون قرمز و نزدیک در نواحی استوایی مریخ جست‌وجو می‌کرد. این مشاهدات امکان بازیابی اولین نقشه‌های کانی‌شناسی سیاره و قمر آن و مطالعه جو مریخ را فراهم کرد. اما طیف‌سنج مادون قرمز هیچ نشانه‌ای از آب پیدا نکرد.
