معماری اولیه خانه ملاباشی که به خانه معتمدی هم معروف است، به دوران صفویه باز می‌گردد و در حکومت زندیه مرمت شد، اما در زمان بازسازی زندیه قسمت‌های مختلفی از معماری صفویه تخریب شد. در دوران صفویه و زندیه، این خانه دارای بخش‌های مختلفی مانند زمستانه و دو اتاق پنج دری بود، اما با ورود ملاباشی به اصفهان و خرید این خانه در زمان قاجار، بازسازی و ساخت و سازهای زیادی در آن صورت گرفت. در دوره حکومت ظل‌السلطان، پسر ارشد ناصرالدین شاه قاجار در اصفهان، تمام آثار دوران صفوی کاملا نابود و یا تا مرز نابودی پیش رفت، اما خانه ملاباشی یکی از بناهایی بود که از ویرانی عظیم جان سالم بدَر برد. خانه ملاباشی توسط منجم ناصرالدین‌شاه به نام حاج میرزا احمد ملاباشی تفرشی اصفهانی خریداری شد که به خوبی از این بنای تاریخی مراقبت کرد. خانه ملاباشی نیز مانند دیگر خانه‌ها و عمارت‌های ایرانی به دو قسمت «اندرونی» یا قسمت خصوصی و «بیرونی» تقسیم می‌شود که این خانه در زمان زندیه دارای دو اتاق پنج دری و یک اتاق زمستان نشین بوده و در زمان تملک ملاباشی، بخش شاه‌نشین و بخش ۹ دری به آن اضافه شد. سال ۱۳۷۹ این خانه توسط خانواده معتمدی خریداری و مرمت شد و به همین دلیل به آن خانه معتمدی نیز می‌گویند. خانه ملاباشی در سال ۱۳۸۱ به‌عنوان میراث ملی به ثبت رسیده است.
