ماهینی مدافع بوشهری در حالی که ۳۶ ساله است، این تصمیم را گرفت. او کار خودش را از استقلال اهواز شروع کرد و در ادامه در تیم های ذوب آهن، پرسپولیس، نساجی، ملوان و سایپا بازی کرد.
او همچنین ۲۳ بازی ملی نیز در کارنامه خود دارد.
ماهینی بیشتر دوران فوتبال خود را در پرسپولیس گذراند و همراه ذوب آهن و پرسپولیس دو بار در فینال لیگ قهرمانان آسیا حاضر بود که هر دو با شکست همراه شد.
حسین ماهینی ۳ قهرمانی در لیگ برتر ایران و یک قهرمانی در جام حذفی را نیز در کارنامه افتخارات خود دارد که با پرسپولیس به دست آمده است.
