همچنین به طور همزمان با به‌‌‌روزرسانی نسخه اپلیکیشن این سرویس، امکان خرید بلیت قطار در کنار خرید بلیت هواپیما و رزرو هتل روی اپ فلایتودی نیز فعال شده است. این اقدام به منظور تسهیل در روند انتخاب خریداران، انتخاب بر اساس قدرت خرید و کمک به مدیریت زمان کاربران انجام شده است تا مسافران در کوتاه‌‌‌ترین زمان ممکن و متناسب با نیاز‌‌‌های خود، ناوگان حمل‌ونقل ریلی یا هوایی مورد نظرشان را انتخاب کنند. فلایتودی، در حال حاضر بلیت تمام شرکت‌های ریلی مهم کشور مانند رجا، راه‌آهن شرقی بنیاد (بن ریل)، فدک، قطار سفیر و ... را در سامانه فروش خود دارد. مسافران بر اساس نوع خدمات، امکانات و کلاس قطار می‌توانند با مراجعه به سایت یا اپلیکیشن فلایتودی، بلیت سفرهای داخلی خود را خریداری کنند.
