۱- شنیده شده برخی ماموران دولتی به صاحبان مجوزهایی که به‌صورت خودکار صادر شده، اعلام کرده‌اند که این مجوزها را قبول ندارند. این در حالی است که صاحبان شناسه یکتا، به‌طورکلی نیازی به مراجعه به ادارات دولتی ندارند و می‌توانند کسب‌وکارشان را شروع کنند. بر اساس تبصره ۶ ماده ۱ قانون تسهیل صدور مجوزها، در مواجهه با استعلام ماموران دولتی، نظامی، انتظامی و ضابطان قضائی، ارائه شناسه یکتای مجوز صادره از سوی دارنده مجوز کفایت می‌کند و درخواست مدارک اضافی از صاحبان شناسه یکتا، جرم محسوب و مرتکب، به یکی از مجازات تعزیری درجه شش موضوع ماده (۱۹) قانون مجازات اسلامی محکوم می‌شود. بر این اساس، اگر مامور دولتی مانع فعالیت اقتصادی صاحب مجوز قانونی (شناسه یکتا) شود، صاحب مجوز می‌تواند مستندات وقوع این جرم (قبول نداشتن مجوز قانونی) را از دکمه شکایت در کارپوشه خود در درگاه ملی مجوزها، اعلام کند تا متخلفان مورد پیگرد قانونی قرار گیرند.
۲- ممکن است برخی از صاحبان این مجوزها، همه شرایط لازم مصرح در درگاه ملی را نداشته باشند و بر اثر کوتاهی مرجع صدور در بررسی به‌موقع درخواست آنها، مجوز به‌طور خودکار صادرشده باشد. در این صورت بهتر است خود متقاضی از کارپوشه خود، این مجوز را لغو کند. مراجع صدور مجوز و نظارت بر فعالان اقتصادی هر حوزه نیز لازم است برای جبران ترک فعل خود در بررسی به‌موقع درخواست‌ها، پرونده صاحبان این مجوزها را بررسی کنند و اگر مجوزی نباید صادر می‌شد، با ذکر شماره شرط مصرح در درگاه ملی که متقاضی فاقد آن شرط بوده، درخواست متقاضی را رد و مجوز صادرشده را ابطال کنند. لازم به یادآوری است در قانون جدید درباره مجوزها (تبصره ۴ ماده ۱۳ قانون تامین مالی تولید ابلاغی اردیبهشت ۱۴۰۳) رد کردن بدون دلیل درخواست مجوز توسط مراجع صدور؛ جرم تلقی شده است؛ ازاین‌رو از مرجع صدور مجوز و نظارت بر فعالان اقتصادی درخواست می‌شود، از ابطال دسته‌جمعی و بدون بررسی این دسته از مجوزها اکیدا خودداری کنند، چراکه بر اساس دستور دادستان محترم کل کشور به رئیس هیات مقررات زدایی، موظف هستیم مستندات وقوع جرایم مربوط به مجوزها را به نمایندگان دادستان اعلام کنیم و در اجرای دستور فوق الاشاره، در هفته‌های اخیر اسناد وقوع جرم یک معاون وزیر، رئیس یک سازمان و شش مدیرکل دستگاه‌های اجرایی، به شعب ویژه تعیین شده توسط دادستانی، اعلام شده است.»
در اطلاعیه درگاه ملی مجوزها از همه مراجع صدور مجوز درخواست شده است که مقررات مربوط به صدور مجوزها را بار دیگر با دقت مطالعه کنند و هر درخواست را در مدت تعیین شده بررسی کنند و اگر متقاضی همه شرایط اعلامی در درگاه ملی برای مجوز مورد نظر را دارد، مجوزش را در زمان مقرر و بدون تاخیر صادر کنند چراکه سامانه صدور خودکار مجوز در صورت تاخیر مرجع صدور، فعال است و بعد از این هم درخواست‌های دچار تاخیر را صادر خواهد کرد.
