بهروز بقایی اولین بار با آزیتا احمدی متولد 1337، دختر زنده یاد مرتضی احمدی بازیگر قدیمی ازدواج کرد ، ثمره این ازدواج یک پسر متولد 1360 به نام بهرنگ می باشد.
آقای بقایی بعد از طلاق از همسر اولش با پرستو گلستانی ازدواج کرد ، این زوج در سال 1375 در مجموعه نوعی دیگر باهم همکار بودند ، این زندگی مشترک نیز بعد از مدتی به طلاق ختم شد.
به هر حال ما همگی به دنبال خوشبختی هستیم. راه های متفاوتی هم برای دست یافتن به این خوشبختی وجود دارد. یکی از این راه ها ازدواج و تشکیل خانواده است.
اما گاه به جایی می رسی که می بینی آنچه را که می خواستی به دست نیاوردی و خب من هم نمی خواهم کسی را مقصر بدانم. بعضی وقت ها نمی شود و باید از صفر شروع کرد. خب من هم از صفر شروع کردم.
بهروز بقایی پس از جدایی از پرستو گلستانی با همسر سومش ندا قاسمیان ازدواج کرد.
